Berikut ini merupakan penghargaan - penghargaan yang telah diraih oleh PTRR-BATAN dari berbagai macam aspek ruang lingkup dan instansi.
| No. | Nama/Instansi dan Jabatan | Tanda Penghargaan / Sertifikat Yang Diterima | Pemberi Penghargaan | Tanggal | Dokumen |
| 1. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka |
Piagam Anugerah Iptek Pranata Litbang (Prayogasala) Kategori Lembaga Litbang Non Kementerian |
Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia | 10 Agustus 2015 |  |
| 2. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka |
Business Innovation Center |
107 INOVASI INDONESIA PROSPEKTIF - 2015 | 30 Desember 2015 |  |
| 3. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka |
Terbaik II Pengelolaan Barang milik Negara Tahun 2017 |
Kantor Pelayanan Kekayaan Negara dan Lelang Tangerang II-Kantor Wilayah DJKN Banten | 23 Januari 2018 |  |
| 4. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka |
Pusat Unggulan Iptek (PUI) Tema : Radiobiomolekul |
Menteri Riset dan Teknologi / Badan Riset dan inovasi Nasional (BRIN) Republik Indonesia | 2 Desember 2019 |  |
| 5. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka | Target PNBP 100% Tahun 2019 | Kepala Biro Perencanaan-BATAN | 15 Januari 2020 |  |
| 6. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka | Top 45 Inovasi Pelayanan Publik Tahun 2020 untuk SUNTIK (Samarium untuk Terapi Paliatif Kanker) | Kementerian Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi Republik Indonesia | 18 Juni 2020 | |
| 7. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka | Predikat Wilayah Bebas dari Korupsi (WBK) | Kementerian Pendayagunaan Aparatur Negara dan Reformasi Birokrasi Republik Indonesia | 21 Desember 2020 |  |
| 8. | Pusat Teknologi Radioisotop dan Radiofarmaka | 112 Karya Inovasi Indonesia Paling Prospektif-2020 | Business Innovation Center (BIC) | 31 Desember 2020 |  |