Dalam melaksanakan tugas dan fungsinya PTKMR didukung oleh keberadaan sarana dan prasarana yang terdapat di Bagian/Bidang, sebagai berikut.

1. Bagian Tata Usaha memiliki fasilitas :

• Ruang Penerimaan sampel (Front Desk)
• Fasilitas Perpustakaan
• Fasilitas Umum

2. Bidang Radioekologi memiliki fasilitas :

• Laboratorium lingkungan
• Laboratorium aerosol
• Laboratorium kelautan
• Laboratorium TENORM
• Laboratorium radon
• Laboratorium radiokimia
• Laboratorium aquatic
  
  Dengan peralatan utama yang dimiliki diantaranya:
• Spektrometer gamma dengan detektor HPGe (6 unit).
• Low background counter
• Kinetic Phosphorescence Analyzer
• Atomic Absorption Spectroscopy (AAS)
• Liquid Scintillation Counter (LSC)
• Spektrometer alfa

3. Bidang Teknik Nuklir Kedokteran dan Biologi Radiasi memiliki fasilitas:

• Laboratorium Teknik Nuklir Kedokteran (in vivo : hot lab, kamera gamma, dose calibrator dan in vitro : gamma counter, ELISA reader, PCR).

• Laboratoirium Radiobiologi (Sitogenetik : metasystem with metaphase finder, FISH applied imaging, dll dan Radiobiologi molekuler : gel doc, realtime PCR dll).

4. Bidang Keselamatan Kerja dan Dosimetri memiliki fasilitas :

• Lab. Evaluasi Dosimetri Personil TLD BARC
• Lab. Evaluasi Dosimetri Personil TLD Harshaw
• Lab. Evaluasi TLD Chip Harshaw
• Lab. Uji Kesesuaian Pesawat Sinar X Radiologi Diagnostik dan Intervensional
• Lab. Uji Bungkusan Radioaktif Tipe A
• Lab. Fisika Medis
• Lab. Dosimetri dan Kimia
• Lab. Pemantauan Dosimetri Internal Personil (WBC)

5. Bidang Metrologi Radiasi memiliki fasilitas :

• Laboratorium Kalibrasi Alat Ukur Radiasi
  Fasilitas yang dimiliki:
  - Fasilitas penyinaran gamma OB-85
  - Fasilitas penyinaran panoramik dan beta paparan
  - Fasilitas penyinaran neutron

  Peralatan utama yang dimiliki:
  - Detektor Exradin A6 Ionisation Chamber 800 cc
  - Detektor NE 2575 Ionisation Chamber 600 cc
  - Elektrometer Keithley 6517B Standard Elektrometer
  - Elektrometer Exradin Max – 4000

  Sumber standar yang dimiliki*):
  - Kalibrator OB-85 : Cs-137, Co-60, Am-241
  - Kalibrator OB-34 : Cs-137
  - Sumber Radiasi Neutron : Cf-252, Am-Be
  - Beta Secondary Standard (BSS) : Sr-90
  - Planar Source : Sr-90, Am-241, I-129
  
  *) Sumber standar tertelusur ke laboratorium standar nasional (SSDL– Jakarta) dan/ atau laboratorium primer (PTB-Jerman, NPL-Inggris, NMIJ-Jepang)

• Laboratorium Standardisasi Radionuklida
  
  Fasilitas yang dimiliki:
  - Fasilitas laboratorium kimia untuk preparasi bahan radioaktif
  - Fasilitas bengkel mekanik dan elektrik
  - Sistem pencacah absolut koinsidensi 
  - Sistem pencacah spectrometer gamma
  - Ionization chamber
  - Sistem pencacah spektrometer alfa,
  - Sistem pencacah gross alfa dan beta
  - Sumber radionuklida standar yang tertelusur ke NPL - Inggris, PTB - Jerman, NMIJ dan ETL - Jepang.

• Laboratorium Standar Nasional LDSS - Jakarta
  
  Fasilitas yang dimiliki:
  - Ruang gamma terapi dengan sumber Co-60
  - Ruang gamma proteksi dengan Kalibrator OB 6 : Cs-137 74 GBq
  - Ruang penyinaran beta dengan sumber BSS-1 (2 units) Sr-90+Y-90 : 74 MBq, 1.85 GBq
  - Ruang penyinaran X-ray Xylon 20-320 kV
  - NE 2575C / 576 IC 600 cc, H’(0,07) Beta BSS
  - NE 2575 / 2693 IC 0,6 cc , Nk and Ndw (Co-60)
  - Exradin A4 IC 30 cc, Cs-137, RQR , RQT
  - Hp(10) IC Type 34035
  - Roos chamber TM 34001 Ndw (Co-60)
  - Pin Poin 3D TW 31016 Ndw (Co-60)
  - HDR1000 Plus Well Type IC

6. Unit Jaminan Mutu memiliki fasilitas :

• Ruang penyimpanan dan pengendalian dokumen mutu PTKMR.